菏澤市工商行政管理局位于開放開發綜合試驗區內，坐落于菏澤市中華東路98號財富中心一號樓七、八、九、十層，辦公面積5017平方米，另有1500平方米商務用樓，建有機關招待所、食堂、理發室、娛樂室。下轄牡丹區、曹縣、巨野、定陶、鄆城、成武、單縣、東明、鄄城9個縣級工商局，141個基層工商所，全系統共有干部職工6024人，在崗人員5613名，其中公務員和事業編制人員2870人，離退休人員701人，超編人員2344人。內設辦公室、人事政工科，財務裝備科、法制科、市場管理科、合同管理科、商標廣告科、消費者權益保護科八個科室;兩個直屬局：企業注冊局、公平交易局;兩個專業機構：機動車輛交易市場管理所、經紀人和生產要素市場管理所;三個直屬事業單位：市消費者協會辦公室、市個體私營企業協會辦公室、工商信息中心;兩個派出機構：菏澤市工商局開放開發綜合試驗區分局、菏澤市工商局花都分局;另設機關黨委和監察室。2008年以來，在省工商局和市委、市政府的正確領導下，菏澤市工商局以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，以科學發展觀為統領，以“建設和諧工商，展示良好形象”為主線，堅持“以人為本、嚴管厚愛、關注基層、關愛民生”的執政理念，各項工作站在了新起點，邁出了新步伐，實現了新發展。先后被省工商局評為“全省工商行政管理系統治理商業賄賂工作先進單位”、“全省工商行政管理系統預算管理工作先進單位”、“全省工商行政管理系統行風建設先進單位”;被市委、市政府評為“全市勞動保障服務工作先進單位”、“全市安全生產工作先進單位”、“菏澤市產品質量和食品安全專項整治先進單位”。

一)負責核定各類企業(包括外商投資企業等)名稱，頒發有關證照，辦理各類企業年檢，查處違反企業登記注冊管理法規的行為;

(二)負責對全市各類市場經營秩序實施規范管理和監督;

(三)負責查處假冒偽劣、壟斷、不正當競爭、傳銷等經濟違法行為;

(四)負責保護消費者合法權益，查處侵犯消費者合法權益的案件;

(五)負責監管經紀人、經紀機構;

(六)負責合同糾紛行政調解和動產抵押物登記工作，監管拍賣活動;

(七)負責對廣告和廣告經營活動實施監管，開展廣告行政執法;

(八)負責商標管理和商標行政執法，組織推薦中國馳名商標和山東省著名商標等。